Nacido en Berastegi, en 1932.
Estudió Filosofía y Teología en los Seminarios de Vitoria y San Sebastián, Ciencias Biológicas en la Universidad de Madrid.
A lo largo de su trayectoria el reconocido antropólogo ha participado en numerosos trabajos de campo como colaborador en excavaciones arqueológicas dirigidas por diversos arqueólogos, especialmente José Miguel de Barandiaran en el País Vasco y otros nacionales y extranjeros en el resto de la Región Cantábrica, desde 1960 hasta 1972. Participación en las excavaciones arqueológicas llevadas a cabo en la Nubia Sudanesa por encargo de la UNESCO. Director de excavaciones arqueológicas desde 1973 hasta la actualidad, especialmente en el País Vasco.
Docencia como catedrático del Instituto J. M. Usandizaga de Enseñanza Media de San Sebastián. Desde 1980 hasta su jubilación en 2002 fue Catedrático de Didáctica de las Ciencias Experimentales en la Universidad del País Vasco. Sus temas principales de investigación y trabajo son Arqueozoología de yacimientos prehistóricos, Arte Paleolítico y Protección del Patrimonio Arqueológico.
Ha asumido cargos de Director del Departamento de Prehistoria de la Sociedad de Ciencias Aranzadi, Director de la revista MUNIBE, Miembro del Comité Internacional del ICAZ, Miembro del Comité de redacción de varias revistas científicas: como la Revista Internacional de Estudios Vascos, Doñana, Acta Vertebrata, Archaeofauna, Archaeozoologia, Anthropozoologica, Férvedes, Miembro de Honor del Centre de Recherches d'Ecologie Souterraine y del ICAZ.
Participación o Dirección de Proyectos de Investigación y Excavaciones en Cueva Morín, La Riera, El yacimiento de la cueva de Ekain, Dufaure, Erralla, la cueva de Amalda, Vidigal (Portugal), Megalitos y Cuevas en Gipuzkoa, Cueva Mirón (Cantabria) etc.
Ha participado en Jurados de Evaluación de Proyectos científicos en la Universidad de Nueva Mexico (USA), Research Council of Canada, Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (Madrid), Consejo Superior de Investigaciones Científicas.
Ha publicado más de 210 títulos, de los que 12 son libros. La mayor parte son trabajos de investigación, pero hay publicaciones didácticas y de divulgación a distintos niveles.
Numerosos premios, los mas destacados son Premio Nacional a la investigación Ibáñez Martín, Premio Xabier María de Munibe, en el campo de las Humanidades del Parlamento Vasco y Real Sociedad Bascongada de los Amigos del País, Premio Eusko Ikaskuntza y Caja Laboral de Humanidades y Ciencias Sociales. Distinción Lan Onari del Gobierno Vasco. Premio Euskadi de Investigación en 2004.
2009
Jesús Altuna presentó ayer el hallazgo del único contorno recortado de ave que se conoce de la época Magdaleniense
http://www.diariovasco.com/v/20110301/cultura/ekainberri-exhibira-replica-contorno-20110301.html - 2011-03-01
Las excavaciones han hallado un contorno de hueso recortado con forma de animal de hace 14.000 años
http://www.noticiasdegipuzkoa.com/2011/03/01/ocio-y-cultura/cultura/un-ave-entre-los-caballos-de-ekain - 2011-03-01
Jesús Altuna ha presentado hoy el hallazgo más destacado de la campaña que se desarrolla desde 2008 en Ekain, el contorno recortado de un ave
http://www.gara.net/azkenak/02/251079/es/Ekainberri-acogera-replica-contorno-recortado-ave-13800-anos - 2011-02-28
Erdi Madeleine garaian, duela 13.862 urte, bisonte baten saihetsean zizelkatutako hegazti bat aurkitu dute
Hallada en Ekain una costilla con el perfil recortado de un pájaro tallado hace 13.860 años.
http://www.diariovasco.com/v/20100903/cultura/prehistorica-unica-20100903.html - 2010-09-03
Jesús Altuna y Koro Mariezkurrena han estudiado los nuevos hallazgos que realizaron en Ekain: una vulva coloreada en la roca y pinturas no figurativas en rojo y negro
http://www.diariovasco.com/20090227/cultura/ekain-habia-callado-20090227.html - 2009-02-27
Jesús Altuna ha vuelto a excavar uno de los yacimientos que mejor conoce, Ekain, declarado Patrimonio de la Humanidad por la Unesco, en busca de más información sobre los individuos que decoraron sus paredes
http://www.noticiasdegipuzkoa.com/ediciones/2008/10/05/mirarte/cultura/d05cul82.1296056.php - 2008-10-05
La apertura de la réplica de Ekain coincide con el inicio de nuevas excavaciones en la cueva, 33 años después de la última campaña. Un equipo dirigido por el arqueólogo y prehistoriador Jesús Altuna trabajará en el yacimiento
http://www.noticiasdegipuzkoa.com/ediciones/2008/09/11/mirarte/cultura/d11cul66.1244505.php - 2008-09-11
Jesús Altuna, responsable del comité científico de la Fundación Ekain y máximo impulsor de este proyecto para crear un 'doble' de la cueva de Zestoa, explicaba el nuevo retraso en la presentación al público de Ekainberri. De todas formas desde hoy se puede ver el gran panel de los caballos de la galería Zaldei, considerado «la joya de la corona», en la exposición que se ha instalado en el edificio donostiarra de Tabacalera.
http://www.diariovasco.com/prensa/20070324/cultura/inauguracion-replica-ekain-retrasa_20070324.html - 2007-03-24
El proyecto de Ekainberri, que ha acumulado numerosos retrasos a lo largo de los años, entra ya en su recta final. De los siete paneles en que está dividida la réplica de Ekain seis están ya terminados, entre ellos el gran panel de los caballos, que corresponde al principal conjunto de pinturas del santuario paleolítico. Este panel -«la joya de la corona», en palabras del director del proyecto, el antropólogo Jesús Altuna- es el protagonista de la exposición inaugurada ayer en Tabacalera, a la espera de que la réplica en su conjunto pueda ser inaugurada en Zestoa.
http://www.gara.net/paperezkoa/20070324/9820/es/El/gran/panel/caballos/replica/Ekain/puede/verse/Tabacalera - 2007-03-24
La reproducción de las pinturas del periodo Paleolítico de la cueva de Ekain, ubicada en Zestoa, podrá visitarse antes de fin de año. De todos modos, la primera réplica de la cueva, el 'Panel de los caballos', ya está disponible para el público desde hoy y hasta el 22 de abril en la Tabacalera de Donostia.
http://www.eitb24.com/noticia/es/B24_41074/a-pie-de-calle/ZESTOA-reproduccion-cuevas-Ekain-abrira-antes-fin-ano/ - 2007-03-23
Jesús Altuna, presidente de la Sección de Prehistoria de Aranzadi y principal valedor del proyecto de la réplica de la Ekain, ya respira tranquilo y con él los responsables de cultura de las instituciones. «Hace tres años no veía más que nubarrones en el horizonte», dijo en la presentación de la maqueta de la escenografía de la caverna que se construirá en Alfa Arte. Esta empresa tendrá 14 meses para realizar la réplica. El diputado González de Txabarri añadió que Ekain Berri estará listo para su inauguración a finales del próximo año.
http://www.gara.net/idatzia/20060510/art163553.php - 2006-05-10
La asociación ha querido premiar el trabajo que ha realizado en los últimos 40 años en el campo de la investigación arqueológica.
El investigador recibió ayer un homenaje de sus compañeros de Aranzadi, entidad que ha presidido, y de las instituciones vascas
http://www.diariovasco.com/pg060309/prensa/noticias/Cultura/200603/09/DVA-CUL-342.html - 2006-03-09